Joniškio istorijos ir kultūros muziejus įkurtas 1989 m. Steigėjas – Joniškio rajono savivaldybės taryba. Direktorė – Rasa Ališauskienė. Muziejuje saugoma ir eksponuojama archeologinė, istorinė, etnografinė medžiaga, pasakojanti apie Joniškio krašto istoriją ir kultūrą, vykdomas menininkų ir mokslininkų, kilusių iš Joniškio krašto darbų populiarinimas. Muziejaus darbuotojai organizuoja ekskursijas po Joniškio rajono ir miesto istorinius objektus. Taip pat organizuojama švietėjiška veikla istorine tematika, rengiami edukaciniai užsiėmimai. Siekdamas išsaugoti istorinę praeitį, muziejus vykdo projektinę veiklą, kraštotyros ekspedicijas Joniškio rajone. Dažnai rengiamos dailės ir liaudies meno parodos.